广州不同线路的地铁运营时间不一样，例如广州地铁1号线东站运营时间为6点10分到23点30，西朗时间为6点到22点55分。广州地铁6号线浔峰岗方向运营时间为6点到22点50分，香雪方向为6点到22点50分。
广州地铁运为了方便节假日市民出行，通常情况下会在假期先做一些改动，比如说国庆之前。整个国庆假期之间从9月30日及10月1日、10月6-8日共5天内延长线网服务时间1小时，同时10月4日（周日），二号线延长运营服务时间30分钟，期间开行广州南往嘉禾望岗单向大站快车，中途停靠洛溪、昌岗、公园前、广州火车站和嘉禾望岗站，停靠站点只下不上。10月1日~10月8日期间每日18:15起至运营结束，万胜围开往广州塔方向列车终点站调整为猎德大桥南站，需要前往后续各站的乘客请在猎德大桥南站下车。