大部分人所说的睾丸疼痛在医学上多指慢性睾丸痛，表现为持续性或间歇性的单侧或双侧睾丸疼痛，时间超过3个月，以隐痛或胀痛为主，对患者生活质量有一定影响。
从临床来看，引起睾丸疼痛的明确因素可归纳为6大类。
一是睾丸病变：1、睾丸炎症，有红肿热痛的表现；2、睾丸肿瘤，可摸到睾丸处有肿大、硬块；3、睾丸扭转，常表现为晚上睡觉突然睾丸剧烈疼痛，不能缓解；4、睾丸外伤，伤口愈合后形成疤痕，牵拉睾丸也会造成疼痛。 二是附睾（多位于睾丸后外方）病变：1、附睾炎症，症状同睾丸炎；2、附睾囊肿，在附睾可摸到一个柔软的圆圆的小肿物；3、附睾淤积或附睾肉芽肿，因输精管结扎导致精液排不出所致，表现为附睾头肿胀，触摸有痛感；4、附睾肿瘤，但发生率极低。 三是输精管结扎。结扎后15％-19％的人会发生睾丸疼痛，有些是因为神经瘤形成，有的则是出现了精子肉芽肿。
四是精索（与附睾尾相接，存在于阴囊和腹股沟里）病变，大部分起因于精索静脉曲张，由于血液回流慢引起淤血，常表现为睾丸隐痛、胀痛，站久了或劳累会使疼痛加剧。 五是泌尿系统疾病，如老年前列腺增生、前列腺炎、尿道狭窄、泌尿系结石特别是输尿管下端结石，以及阴囊鞘膜积液。 六是泌尿生殖系统外的因素，如疝气、脊柱的神经根炎、腰椎间盘突出、肠道激惹综合征等。患者有焦虑、抑郁等心理问题的，诱发睾丸疼痛的可能性也很大。 此外，据国外报道，有25％-50％的睾丸痛是找不到任何原因的，这种叫特发性睾丸痛，大部分患者都有一定的心理问题。